生物信息学中计算机技术应用陈绮作者简介、书籍目录、内容摘要、编辑推荐

　　 本书结合计算机图形图像处理、模式识别、数据挖掘等技术，利用当前关于蛋白质结构研究的最新成果，讨论蛋白质三维结构比较中兼顾全局比较与部分比较的关键问题，有效解决了蛋白质三维结构的多层次比较。内容包括蛋白质三维结构的可视化、蛋白质三维结构统一坐标系的建立、统一坐标系下蛋白质结构频谱建立、基于灰色关联的蛋白质三维结构相似性算法研究以及蛋白质三维结构空间复杂性的分形研究。

　　书籍目录

　　第1章 绪论 　1.1 引言 　1.2 生物信息学 　1.3 生物信息学中的计算机技术应用 　1.4 蛋白质结构模型 　1.5 生物系统背景知识 　1.6 本书研究的内容 　1.7 本书的组织结构 　1.8 本章小结 第2章 生物信息学中的结构比较 　2.1 结构比对（Structure Alignment） 　2.2 VAST与DALI 　2.3 全局与局部结构比较 　2.4 利用数学记号进行结构比较 　2.5 生物大分子表面结构的比较 　2.6 本章小结 第3章 三维结构比较 　3.1 三维结构比较研究 　3.2 基于体模型的比较 　3.3 基于三维模型几何相似性的比较 　3.3.1 基于轮廓的几何相似性比较算法 　3.4 三维模型相似性度量方法的分类 　3.5 本章小结 第4章 蛋白质三维结构可视化 　4.1 蛋白质存储结构分析 　4.2 PDB文件中对于大分子结构的描述 　4.3 MATLAB下蛋白质三维结构可视化实现 　4.4 本章小结 第5章 建立蛋白质三维结构频谱 　5.1 三维物体形状特征提取 　5.2 统一坐标系的建立 　5.3 小波分析 　5.4 基于蛋白质碳原子距离的多分辨频谱建立 　5.5 基于统一坐标序列的蛋白质三维结构多分辨频谱建立 　5.6 本章小结 第6章 蛋白质三维结构相似性 　6.1 三维模型相似性比较 　6.2 灰色系统理论概述 　6.3 蛋白质三维结构相似性的灰色关联分析 　6.4 蛋白质三维结构频谱的灰色关联分析 　6.5 本章小结 第7章 蛋白质三维结构空间复杂性 　7.1 生物学中的分形[Den06] 　7.2 分形的概述 　7.3 基于分形的蛋白质三维空间结构复杂性研究 　7.4 基于结构频谱分维的蛋白质三维结构相似性比较 　7.5 本章小结 第8章 蛋白质三维结构视图系统 　8.1 系统框架 　8.2 系统功能 　8.3 本章小结 后记 　一、相关研究 　二、有关蛋白质三维结构预测的研究 参考文献

　　章节摘录

　　《Nucleic Acids Research》杂志连续7年在其每年的第1期中详细介绍最新版本的各种数据库。在2000年1月1日出版的第28卷第l期中详细地介绍了115种通用和专用数据库，包括详尽描述和访问网址。迄今为止，生物学数据库总数已达500个以上。在DNA序列方面有GenBank、EMBL和DDBJ等；在蛋白质一级结构方面有SWISS-PROT、PIR和MIPS等；在蛋白质和其他生物大分子的结构方面有PDB等；在蛋白质结构分类方面有SCOP和CATlH等。应该指出，几乎所有这些数据库对学术研究部门或人员来说都是免费的，可以免费下载或提供免费服务。但是，鉴于相当多的数据库经营者们面临着资金紧缺的境地，这种免费的局面还能维持多久就不得而知了。有的数据库，如SWISS-PROT，已开始向商业用户每年收取数千至数万美元不等的使用费。其他数据库暂时还是免费的，但不知是否永远免费。如果一些重要的数据库对学术研究部门开始收费，这对于我国生物信息学的发展是非常不利的。中国是一个基因信息资源大国，应当抓紧建设我国自有的数据库，在世界上作出贡献，在平等的基础上与国外共享生物信息资源。